--- title: "Explorar los datos célula a célula · Miriam González" canonical_url: "https://helpmiriam.com/celula-a-celula/explorar" last_updated: "2026-10-19T08:21:18.333Z" meta: description: "El mapa de células de las dos biopsias de Miriam: busca un gen o elige un marcador y míralo célula a célula en el mapa y grupo a grupo, con su n y su suelo ambiental." "og:description": "El mapa de células de las dos biopsias de Miriam: busca un gen o elige un marcador y míralo célula a célula en el mapa y grupo a grupo, con su n y su suelo ambiental." "og:title": "Explorar los datos célula a célula" "twitter:description": "El mapa de células de las dos biopsias de Miriam: busca un gen o elige un marcador y míralo célula a célula en el mapa y grupo a grupo, con su n y su suelo ambiental." "twitter:title": "Explorar los datos célula a célula" --- [Célula a célula](https://helpmiriam.com/celula-a-celula)Para profesionales # Explorar los datos célula a célula Apoyo a la decisión de su equipo médico. No es diagnóstico ni consejo médico. - n=1, FFPE, exploratorio - ARN ≠ proteína; manda la IHQ - IHQ de HER2: 0 (primario e hígado) - IHQ de RE: negativa (hígado) Cargando el explorador…
Cómo leerlo
n=1, FFPE, exploratorio.
Dos biopsias pequeñas de una sola paciente, fijadas en formol e incluidas en parafina. Sirve para generar hipótesis, que habrá que confirmar con otras pruebas.
ARN ≠ proteína; manda la IHQ.
El análisis lee ARN. Que un gen se lea no dice que la proteína esté; eso lo dice la inmunohistoquímica.
Suelo ambiental.
En una muestra así flota ARN suelto que cae en cualquier célula. Para cada gen y grupo se calcula cuántas células saldrían positivas solo por eso; lo que no supera ese suelo no cuenta. En el hígado es un mínimo: para los genes del tumor se queda corto, y lo que decide es la referencia emparejada. Además, las sondas que caen dentro de un exón también leen ADN genómico del tejido; en el hueso pesa más, y su suelo lo incluye. Junto a cada gen verás cuántas de sus sondas cruzan una unión entre exones.
Matriz estándar de Cell Ranger, todas las sondas; en el hueso incluye ADN genómico.
Son las cuentas que da Cell Ranger con todas las sondas del panel, la misma base del análisis revisado.
Cifras circulares.
Si un gen se usó para elegir las células de un grupo, su cifra en ese grupo sale alta (o baja) por construcción. Esos genes llevan su rótulo y, cuando la revisión lo midió sin esa circularidad, esa otra cifra al lado.
Mediana por célula detectada; la revisión da pseudobulk, así que las cifras de nivel no tienen por qué coincidir.
El nivel que pinta la página es la mediana en las células donde se detecta el gen; la revisión da el nivel de toda la población junta.
Lectura de Polaris.
La lectura por gen es de Polaris y está en borrador, pendiente de la lectura humana del laboratorio. No habla en nombre del laboratorio.
Referencia emparejada.
Células no tumorales de la misma muestra, con la misma profundidad (moléculas por célula); en el hígado son linfocitos T y NK, mieloides y endotelio; los hepatocitos y los fibroblastos no entran. Si un gen se detecta igual o más en la referencia que en el grupo de interés, no sirve para distinguir el tumor.
Grupos fijos.
Los grupos y su n vienen del análisis revisado. La página no vuelve a agrupar células ni calcula un «% de células tumorales» del hígado.
El resumen en texto de estos datos está en [~~Célula a célula~~](https://helpmiriam.com/celula-a-celula).
## El fichero completo, a petición La matriz de todos los genes ya se puede leer aquí, gen a gen. Si necesitas el fichero completo (h5ad, sin identificadores) para investigación, escríbenos desde [~~Contacto~~](https://helpmiriam.com/contacto).